Die Eroberung Südostasiens durch Japan in den ersten Monaten des Jahres 1942 unterbrach Australiens Flugverbindung nach Großbritannien. In seiner dunkelsten Stunde und mit seinem eigenen Territorium unter Beschuss war Australien isoliert. Ab Juni 1943 wurde die Strecke jedoch wieder eröffnet, als Qantas Catalinas den Flugbetrieb zwischen Perth und Ceylon aufnahm, eine Strecke von 3.500 Meilen und damals die längste Flugverbindung der Welt. Mit einer durchschnittlichen Flugzeit von 27 Stunden wurde die Strecke in Funkstille geflogen, da sie japanisches Patrouillengebiet durchquerte. Aufgrund der Länge der Flüge erlebten die Passagiere an Bord zwei Sonnenaufgänge, woraus sich der Begriff "Double Sunrise"-Service entwickelte. Fünf Monate nach ihrer Eröffnung wurde die Strecke um weitere 1.490 Meilen bis nach Karachi verlängert. Mitte 1944 nahmen Qantas Liberators den Flugbetrieb auf, die viel schneller waren und eine kürzere Strecke zwischen Ceylon und dem Exmouth Gulf ermöglichten. Schließlich wurden 1945 Qantas Lancastrians eingeführt. Trotz der Länge und Abgeschiedenheit der Strecke verlief der Flugbetrieb während des Krieges unfallfrei. Leider wurde diese Bilanz getrübt, als eine Lancastrian während eines der letzten Flüge über den Indischen Ozean im März 1946 verschwand. Kurz darauf wurde der Flugdienst wieder auf die traditionelle Route über Singapur zurückverlegt. Der Flugdienst von Qantas über den Indischen Ozean während des Krieges ist eine Geschichte von bemerkenswerter Flugkunst und Professionalität. Jahrzehnte später kommentierte der Gründer von Qantas, Sir Hudson Fysh, dies mit den Worten: "Ich habe immer geglaubt, dass dies das faszinierendste und romantischste Unterfangen war, das Qantas jemals durchgeführt hat".
